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Générateur gratuit de schéma de régulation génique

Reliez un activateur, un répresseur et un gène cible par des relations d’activation ou de répression, puis comparez les préréglages de rétrocontrôle et de connexions personnalisées.

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Réseau de régulation génique

Choisissez un schéma scientifique prédéfini, modifiez les libellés et exportez le résultat dans votre navigateur.

Options du schéma
Libellés scientifiques
Relations régulatrices
Facteur de transcription → Gène cible
Répresseur → Gène cible
Gène cible → Produit génique

Générateur gratuit de schéma de régulation génique— modèles et exemples

Mis à jour

Schéma de régulation génique

Générateur gratuit de schéma de régulation génique

Reliez un activateur, un répresseur et un gène cible par des relations d’activation ou de répression, puis comparez les préréglages de rétrocontrôle et de connexions personnalisées.

Un schéma de régulation génique montre comment des facteurs activent ou répriment l’expression génique. SciFig propose un modèle délimité comprenant un facteur, un répresseur, un gène cible et son produit, avec des libellés modifiables, des flèches d’activation, des extrémités de répression et une connexion de rétrocontrôle négatif optionnelle.

Créer le schéma de régulation génique
Modèle de régulation génique avec activateur et répresseur reliés à un gène cible et à son produit
  • Nommer le facteur régulateur
  • Utiliser une flèche d’activation
  • Afficher une relation de retour
  • Ajouter ou supprimer des relations d’activation ou de répression

Fonctions du schéma de régulation génique

Rendez visibles les facteurs, leurs gènes cibles et le sens des relations régulatrices.

Relier un régulateur à sa cible

Placez un facteur de régulation et un gène cible dans une relation claire. Nommez-les avec les termes de votre document. Le schéma met cette connexion au premier plan pour identifier qui agit sur quelle cible avant d’aborder un réseau plus large.

  • Nommer le facteur régulateur
  • Identifier le gène cible
  • Conserver la direction de la relation
Relier un facteur à sa cible

Distinguer activation et répression

Choisissez une flèche pour l’activation et une extrémité en barre pour la répression. Changer le type de relation conserve les objets prédéfinis tout en modifiant l’effet indiqué. Les extrémités distinctes restent lisibles en niveaux de gris ou avec une autre palette de couleurs.

  • Utiliser une flèche d’activation
  • Utiliser une barre de répression
  • Distinguer les effets par l’extrémité du lien
Choisir l’effet régulateur

Expliquer une boucle de rétrocontrôle

Le préréglage de rétrocontrôle relie un produit ou régulateur en aval à une étape antérieure. Cette boucle représente une relation fournie dans le mécanisme, pas une prédiction calculée à partir de valeurs d’expression. Elle permet de dépasser une simple succession à sens unique.

  • Afficher une relation de retour
  • Nommer les éléments de la boucle
  • Distinguer boucle et chaîne linéaire
Afficher le rétrocontrôle

Modifier un modèle régulateur compact

Reliez l’activateur, le répresseur, le gène cible et le produit prédéfinis selon les relations nécessaires à votre explication. Renommez les objets, choisissez l’effet de chaque connexion et exportez la figure. Le schéma consigne les liens saisis sans inférer un réseau à partir d’une table RNA-seq.

  • Renommer les objets régulateurs prédéfinis
  • Ajouter ou supprimer des relations d’activation ou de répression
  • Exporter le modèle saisi en SVG ou PNG
Modifier les connexions régulatrices

Comment créer la figure

Préparez votre figure avec les commandes ci-dessous, puis téléchargez le résultat.

  1. Choisir un exemple facteur-cible

    Commencez avec la vue générale, un exemple activateur ou un exemple répresseur. Les facteurs et le gène cible gardent une disposition stable. Choisissez le préréglage correspondant à la relation à expliquer avant d’en modifier les noms.

  2. Définir les liens et le rétrocontrôle

    Choisissez la source, la cible et l’effet activateur ou inhibiteur. Vous pouvez modifier ou supprimer les relations existantes. Activez le rétrocontrôle du produit génique lorsque votre explication comporte cette relation de retour.

  3. Adapter le titre et les noms

    Donnez un titre descriptif et remplacez les libellés par les termes du document. Le préréglage conserve sa disposition pendant ces changements. Gardez les mêmes abréviations pour les facteurs et gènes dans la figure et le texte.

  4. Exporter le schéma légendé

    Téléchargez le SVG pour une figure vectorielle ou le PNG pour une présentation ou une fiche. L’export conserve les relations et libellés choisis. Rangez la figure avec l’explication correspondante pour pouvoir en produire une nouvelle version.

Utilisations du schéma de régulation génique

Une figure légendée relie votre explication à un support visuel pour la recherche et l’enseignement.

Modèle de régulation génique avec activateur et répresseur reliés à un gène cible et à son produit

Expliquer la régulation transcriptionnelle

Un panneau pédagogique peut placer un activateur et un répresseur à côté d’un même gène cible. Nommez les objets et attribuez à chaque lien l’effet indiqué. Le lecteur voit ainsi comment le contrôle se relie au produit génique sans confondre ce schéma avec les étapes de synthèse des protéines.

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Modèle de régulation génique avec activateur et répresseur reliés à un gène cible et à son produit

Comparer contrôle positif et négatif

Préparez deux schémas avec les mêmes noms de régulateur et de cible, mais des types de liens différents. Les étudiants peuvent comparer flèches d’activation et barres de répression en conservant les mêmes objets. Ces extrémités restent dans le fichier exporté pour que les relations soient lisibles hors de la diapositive.

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Modèle de régulation génique avec rétrocontrôle négatif du produit génique sur le facteur de transcription

Introduire le rétrocontrôle en séminaire

Activez la connexion de rétrocontrôle pour montrer le retour du produit génique vers son régulateur. Comparez cette vue avec un schéma portant les mêmes libellés sans rétrocontrôle. Les deux panneaux rendent la différence de relation visible pendant un séminaire ou une discussion au laboratoire.

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Modèle régulatoire personnalisé avec une liaison activatrice supplémentaire du produit génique vers le répresseur

Résumer un petit modèle régulateur

Un aperçu de projet peut montrer un activateur et un répresseur agissant sur un gène cible, avec le produit de ce gène. Nommez les objets prédéfinis et choisissez chaque type de relation. Vous obtenez un panneau mécanistique compact, sans présenter une inférence de réseau d’expression ou un calcul d’expression différentielle.

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Modèle de régulation génique avec activateur et répresseur reliés à un gène cible et à son produit

Associer régulation et données d’expression

Placez le schéma régulateur à côté d’un graphique d’expression préparé indépendamment. Gardez les mêmes noms de facteurs et de cible dans les panneaux et utilisez le schéma pour expliciter les relations discutées. Une carte thermique peut résumer les mesures séparément ; le schéma ne calcule pas l’expression différentielle.

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Modèle de régulation génique avec activateur et répresseur reliés à un gène cible et à son produit

Préparer une référence sur le contrôle génique

Exportez un SVG légendé pour un manuscrit ou un PNG pour les notes de cours. Conservez les noms du régulateur, de la cible et du produit, ainsi que les extrémités distinctes des liens. Un diagramme de synthèse des protéines peut expliquer séparément transcription et traduction si ce contexte est utile.

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Comment les chercheurs utilisent SciFig

Mon support de cours devait montrer un activateur et un répresseur agissant sur le même gène, pas une nouvelle séquence de transcription et de traduction. Le schéma de régulation génique réunissait facteur, cible et produit. J’ai choisi les types de connexions et exporté la figure pour comparer en cours comment les effets indiqués changeaient l’explication du mécanisme.

Mira L.

Enseignante en génétique moléculaire, Université d’Helsinki

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Questions sur le schéma de régulation génique

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Arrière-plan d'appel à l'action

Schéma de régulation génique

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