Volcano Plot erstellen

Ein Volcano Plot setzt die Effektstärke vieler untersuchter Merkmale in Beziehung zu ihrer statistischen Signifikanz. Bei der Analyse differenzieller Expression steht jeder Punkt häufig für ein Gen oder Protein. Die horizontale Position zeigt meist den log2-Fold-Change, die vertikale Position den negativen Zehnerlogarithmus des gewählten p-Werts. Geben Sie an, ob der p-Wert korrigiert oder unkorrigiert ist, und benennen Sie die Vergleichsrichtung.

Berechtigte Konten können die Erstellung mit verfügbaren Gratis-Credits ausprobieren. Dafür benötigen Sie ein registriertes Konto und ausreichend Credits; die Nutzung ist weder unbegrenzt noch anonym. Auf der aktuellen Preisseite erfahren Sie, welche Credits verfügbar sind und wie viele Ihre gewählten Generierungs- oder Bearbeitungsoptionen kosten.

Diese Seite erstellt aus einer Beschreibung eine KI-generierte Illustration. Sie liest keine CSV-Datei ein, um daraus exakte Punktkoordinaten zu bestimmen, führt keinen Test auf differenzielle Expression durch und berechnet keine korrigierten p-Werte. Für eine Abbildung mit Messergebnissen verwenden Sie zunächst Statistiksoftware und bewahren das daraus erzeugte Datendiagramm auf. Nutzen Sie SciFig für erklärende Volcano-Plot-Schemata und kennzeichnen Sie diesen Zweck deutlich.

Benennen Sie sowohl die Transformation als auch den Vergleich. Beim log2-Fold-Change müssen beispielsweise die Gruppe im Zähler und die Referenzgruppe angegeben sein. An der vertikalen Achse sollte stehen, ob der negative Zehnerlogarithmus korrigierter oder unkorrigierter p-Werte dargestellt wird. Ein positiver log2-Fold-Change bedeutet höhere Werte in der Gruppe im Zähler. Ein Online-Tool für Volcano Plots kann diese Festlegungen nicht aus der Form der Punktwolke ableiten.

Verwenden Sie Grenzwerte, die durch Ihren Analyseplan und Ihre statistische Methode begründet sind. Es gibt kein universelles Grenzwertpaar für jede Studie. Zeigt eine Lehrabbildung Grenzlinien, kennzeichnen Sie diese als Beispiele und stimmen Sie die Punktfarben darauf ab. Lassen Sie ein Tool zur Erstellung von Volcano Plots keine Grenzwerte für Ihre Forschung wählen oder erfinden.

Sie können ein erzeugtes Schema prüfen, mit den unterstützten Bearbeitungsfunktionen überarbeiten und ein verfügbares Exportformat wählen. Ob PNG/JPG sowie Vektor- oder Präsentationsexporte zur Verfügung stehen, hängt vom Ergebnis und den verwendeten Verarbeitungsschritten ab. Prüfen Sie die tatsächlich exportierte Datei und bewahren Sie bei der Darstellung von Daten das ursprüngliche Statistikdiagramm auf. Auch durch Bearbeitung wird ein Schema nicht zum Beleg für Messergebnisse.