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免费基因调控图生成器

用带作用类型的连接组织激活因子、抑制因子和靶基因,并比较反馈与自定义连接预设。

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基因调控网络

选择机制预设,编辑标注,并在本地导出图形。

图形选项
科学标注
调控连接
转录因子 → 靶基因
抑制因子 → 靶基因
靶基因 → 基因产物

免费基因调控图生成器— 模板与示例

更新于

基因调控绘图工具

免费基因调控图生成器

用带作用类型的连接组织激活因子、抑制因子和靶基因,并比较反馈与自定义连接预设。

基因调控图展示调控因子如何激活或抑制基因表达。SciFig 提供由调控因子、抑制因子、靶基因及基因产物组成的有界模型,支持编辑标注、使用激活箭头或抑制端点,以及添加可选的负反馈连接。

基因调控模型:激活因子与抑制因子连接同一个靶基因及其产物
  • 为调控因子命名
  • 使用激活箭头
  • 显示返回上游的调控连接
  • 编辑激活与抑制连接

基因调控图功能

在 SciFig 中集中设置基因调控图的内容、连接视图及导出结果。

连接调控因子与靶基因

用清晰的关系图连接调控因子与靶基因,并按材料中的名称标注两者。先展示哪个因子作用于哪个靶基因,帮助读者理解局部调控关系,再进一步讨论更大的网络。

  • 为调控因子命名
  • 标注靶基因
  • 保留连接方向
连接调控因子与靶基因

区分激活与抑制

选择箭头表示激活,或使用平头端点表示抑制。改变作用类型时,预设对象保持不变,连接所表达的作用随之改变。不同端点让图形在灰度显示或与其他配色并列时仍然清楚可读。

  • 使用激活箭头
  • 使用抑制端点
  • 通过连接端点区分作用
区分激活与抑制

讲解调控反馈环路

使用反馈预设,展示下游产物或调控因子如何连接回前面的调控步骤。反馈是所描述机制中的关系,而不是根据表达量作出的预测。以局部环路为例,便于课程进一步讲解单向通路之外的调控。

  • 显示返回上游的调控连接
  • 标注环路组分
  • 区分反馈与单向链路
讲解调控反馈环路

编辑紧凑的调控模型

按讲解需要,在预设的激活因子、抑制因子、靶基因和基因产物之间建立关系。重命名对象,选择各连接的作用,再导出图形。图中记录的是你输入的关系,而不是从 RNA-seq 表格中推断的网络。

  • 重命名预设调控对象
  • 添加或移除激活、抑制连接
  • 将所设模型导出为 SVG 或 PNG
编辑调控连接

如何绘制图形

使用下方基因调控图控件,按所选机制和标注制作图形。

  1. 选择调控因子与靶基因示例

    选择总览或重点示例,先查看转录因子、抑制因子、靶基因与基因产物之间的连接。图中对象的位置保持稳定,可以先确认要说明的激活、抑制或反馈关系,再将对象名称改为材料中的实际用词。

  2. 设置连接与反馈

    选择起点和终点节点,并为指定关系设置激活或抑制作用。可按需修改或移除已有连接。内容涉及返回上游的调控关系时,开启基因产物反馈选项,以展示单向链路之外的连接。

  3. 编辑标题与标注

    输入清晰的标题,将调控因子、靶基因和产物的名称改为文档采用的术语。更名时,预设对象的布局与已选择的连接作用保持不变。对照正文检查分子缩写,并确认图中激活箭头和抑制端点仍对应要说明的关系。

  4. 下载标注后的图形

    选择 SVG 可获得可缩放矢量图,PNG 则适合幻灯片、讲义或文档。导出结果保留所选视图和标注。将图与配套说明一起保存,后续文字变更时便于同步调整并重新导出。

基因调控图的用途

用带标注的基因调控图,将材料中的机制说明转化为可见图形。

基因调控模型:激活因子与抑制因子连接同一个靶基因及其产物

讲解转录调控

在教学分图中,将激活因子和抑制因子放在同一个靶基因旁。标注调控对象,为各连接选择所描述的作用,让读者理解调控与基因产物的关系,并与蛋白质合成各阶段的示意图区分。

查看此示例
基因调控模型:激活因子与抑制因子连接同一个靶基因及其产物

对照正调控与负调控

沿用相同的调控因子与靶基因名称,制作作用类型不同的两张图。学生可在熟悉的对象之间比较激活箭头和抑制端点。端点形状保留在导出图中,离开课程幻灯片后也能明确表达各连接的作用。

查看此示例
基因调控模型:基因产物对转录因子形成负反馈

在专题报告中介绍反馈

开启反馈连接,展示基因产物返回调控因子的关系。再与标注相同、未启用反馈的图并列比较,便于在专题报告或实验室讨论中直观看到关系的变化。

查看此示例
自定义调控模型:新增基因产物对抑制因子的激活连接

概括局部调控网络

在项目概览中展示激活因子、抑制因子对靶基因的作用,以及对应基因产物。为预设对象命名,选择各连接的作用类型,用紧凑的机制分图概括关系,与表达网络推断或差异表达计算分开呈现。

查看此示例
基因调控模型:激活因子与抑制因子连接同一个靶基因及其产物

结合调控机制与表达数据

将调控图与独立制作的表达量图表并列,各分图中的因子与靶基因名称保持一致,用机制图说明正在讨论的关系。热图可单独概括测量结果;机制图本身不计算差异表达。

查看此示例
基因调控模型:激活因子与抑制因子连接同一个靶基因及其产物

制作基因调控参考图

导出带标注的 SVG 用于论文分图,或导出 PNG 用于学习笔记。保留调控因子、靶基因和产物名称,以及不同作用端点。需要更广的背景时,可另用蛋白质合成图说明转录与翻译。

查看此示例

研究者如何使用 SciFig

我的教学分图需要展示激活因子和抑制因子作用于同一个基因,而不是再画一遍转录与翻译。基因调控图将因子、靶基因和产物放在一起。我选择各连接的作用类型并导出图形,让学生比较不同作用如何改变机制的解释。

Mira L.

赫尔辛基大学|分子遗传学讲师

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基因调控图常见问题

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行动号召背景

基因调控图

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