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免费 UpSet 图生成器：多集合交集可视化

输入二至八个集合的元素清单，计算互斥交集、比较集合大小，导出可编辑的 SVG 或 PNG 图。

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免费 UpSet 图生成器：多集合交集可视化— 模板与示例

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免费 UpSet 图生成器：多集合交集可视化

输入二至八个集合的元素清单，计算互斥交集、比较集合大小，导出可编辑的 SVG 或 PNG 图。

UpSet 图用点阵表示元素所属的集合组合，并用柱形显示各交集的元素数量。 输入二至八个集合的元素清单，计算互斥交集、比较集合大小，导出可编辑的 SVG 或 PNG 图。

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UpSet 图的三集合示例与八集合点阵对照
  • 精确统计互斥交集
  • 读懂交集点阵
  • 筛选需要展示的交集
  • 导出可复现的图

用 UpSet 图理清集合交集

从元素清单到互斥交集，再到可重现的图稿，按实际归属比较多份集合。

精确统计互斥交集

SciFig 根据元素完整的集合归属进行分组。同时属于 A、B、C 的元素只计入三重交集，不会再次计入仅属于 A 和 B 的柱形。每个集合先去除重复元素，再计算集合大小和交集。

  • 支持二至八个命名集合
  • 集合内自动去重
  • 按完整归属统计互斥交集
精确统计互斥交集

读懂交集点阵

沿同一列的连点查看参与交集的集合，上方柱形表示恰好属于这一组合的元素数。集合大小柱形单独显示各输入集合的完整数量，便于将共享的小组与原始清单比较。

  • 连点标明参与集合
  • 柱形表示交集大小
  • 集合总量单独展示
读懂交集点阵

筛选需要展示的交集

按大小、参与集合数或集合组合排序，并设置最小交集数量、显示列数或隐藏指定交集。这些操作只改变显示内容，原始集合和并集总量仍按完整清单计算。保存设置后，同事可重现排列或修改显示。

  • 调整交集排序
  • 筛选可见交集
  • 保留原始总量
筛选需要展示的交集

导出可复现的图

下载 SVG 用于缩放编辑，或下载 PNG 放入幻灯片。JSON 保存集合名称、元素清单与显示选项，重新打开即可继续修改。计算和绘制均在浏览器本地完成，图中关系来自输入清单。

  • 下载矢量 SVG
  • 下载 PNG 图片
  • 保存并重新打开 JSON
导出可复现的图

如何制作 UpSet 图

输入、查看、筛选和导出，整个集合比较流程在浏览器内完成。

  1. 命名集合并输入元素

    为集合添加清晰的名称，按行输入元素。同一个元素在不同集合中应使用相同标识；同一清单内的重复项只计一次，拼写不同则视为不同元素。

  2. 查看集合归属

    输入更新后即可查看互斥交集与集合大小。每根交集柱形下的点阵标明参与集合；即使一个元素出现在多个清单中，它也只属于一个完整归属组合。

  3. 选择展示方式

    选择符合说明目的的排序和筛选条件。可以只展示部分组合而不改变集合大小，解读时结合点阵与集合总量一起查看。

  4. 下载图和设置

    导出 SVG 或 PNG，并保存 JSON 设置。重新打开设置文件后，可保留原始清单，继续修改集合名称或显示方式。

UpSet 图的科研与教学用途

比较基因、筛选与文献清单，或讲解多集合的归属关系。

UpSet 图的三集合示例与八集合点阵对照

比较基因清单

使用一致的基因标识，比较不同对照中的差异表达基因清单。互斥交集能区分某一对照独有的基因与恰好由指定组合共享的基因。

查看此示例
五集合 UpSet 点阵与交集柱形

比较筛选命中项

整理多轮筛选中人工确认的命中清单。集合柱形显示各清单规模，交集柱形显示共同入选项；图形本身不计算筛选显著性。

查看此示例
八集合 UpSet 图，按参与集合数排序

整理文献集合

用文献标识比较阅读清单或检索结果。输入相同标识即可识别重叠，便于团队在分配阅读或去除重复记录前查看交集。

查看此示例
三集合 UpSet 图，展示互斥交集与并集总量

讲解维恩图的替代形式

先用三集合介绍互斥交集，再增加集合数量，说明 UpSet 点阵的优势。可配合维恩图讲解两种表达中的归属对应关系。

查看此示例
五集合 UpSet 点阵与交集柱形

汇总注释类别

比较归入多个类别的条目清单。带有多个标签的元素进入其完整组合，清晰命名类别，避免将可重叠归属误读为互斥分类。

查看此示例
二集合 UpSet 图，仅显示达到最小数量的交集

共享集合比较图

将设置文件和导出图一起交给合作者，对方可重新打开清单并调整排序。此图概括集合归属，不代表富集、统计显著性或因果关系。

查看此示例

研究人员如何使用 UpSet 图

讨论基因清单时，我们总把共有命中项和互斥重叠混在一起。我把三个命名清单输入 UpSet 图生成器，按照笔记检查三重交集。点阵与柱形让团队有了一张统一的图；我把设置和会议幻灯片一起保存，便于下次比较。

Maya Chen

计算基因组学研究员 · University of Edinburgh

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每一种科研插图，都有对应的工具

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插图、结构示意与概念图

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统计图表与科研绘图

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