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出版向けの科学図表

ボルケーノプロット作成を無料で試す

対象アカウントのクレジットでボルケーノプロット作成を無料で試せます。AIで説明用の模式図を作成し、実測データのプロットには統計ソフトを使用してください。

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SciFig Team が確認済み更新日

ボルケーノプロット作成を無料で試す— テンプレートと作例

科学的な説明をわかりやすくするボルケーノプロット作成

軸と比較の方向を説明する

軸と比較の方向を説明する

変動比と有意性を示す、ラベル付きの模式図を作成できます。横軸の比較対象、縦軸の変換方法、各色の意味を説明してください。これらをまとめて確認し、見栄えのよい点群が、計算していない統計結果を示しているように見えないようにします。

結果を作り出さずにしきい値の領域を示す

結果を作り出さずにしきい値の領域を示す

オンラインのボルケーノプロット作成ツールは、効果量と有意性の基準によって図がどのような領域に分かれるかを説明するのに役立ちます。教材であることが明確なラベルをSciFigに指定し、例示と実験的な証拠を区別してください。実際の解析のしきい値は、生成画像ではなく解析手法に基づいて決める必要があります。

授業や発表用の模式図を準備する

授業や発表用の模式図を準備する

研究手法の授業、研究室での議論、発現変動解析の結果を読むための解説に使える図を作成します。ラベルを確認し、その結果で利用可能なオプションを使って書き出してください。正確なデータのプロットでは、各点の根拠となる統計ソフトの出力を保持します。

ボルケーノプロットとは?

ボルケーノプロットは、効果量と統計的有意性の関係を示す図です。一般に横軸には変動比の底を2とする対数であるlog2変動比、縦軸には種類を明記したp値の常用対数に負号を付けた−log10(p値)を用います。SciFigは、授業や解説でこの構造を示す模式図の作成を支援します。対象アカウントのクレジットで無料体験し、ラベルを確認してください。AIが生成する点は模式的なもので、実験データから計算したものではありません。

ボルケーノプロットを模式図で説明する理由

  • 効果量と有意性を一つの説明図で関連付ける
  • 小さなp値と大きな変動比が、それぞれ異なる問いに答えることを示す
  • 分子となる群と基準群を読み手に明示する
  • 補正済みp値と未補正p値の違いを説明する
  • 実際の解析に入る前にしきい値の領域を紹介する

ボルケーノプロットの主な構成要素

  • 横軸:使用する効果量の指標。一般にはlog2変動比
  • 縦軸:種類を明記したp値の常用対数に負号を付けた−log10(p値)
  • 点:データから得たプロットでは、遺伝子やタンパク質などの解析対象
  • しきい値の線:解析に応じた基準値、または教材用と明記した例
  • 色の凡例:強調した各領域を定義する正確な基準
  • 注釈:元データで裏付けられる場合にのみ記載する、選択した解析対象の名称

説明用のボルケーノプロットが役立つ場面

  • 発現変動解析の結果の読み方を教える
  • 研究室のミーティングで変動比の方向を説明する
  • 手法の解説で効果量と有意性の基準を比較する
  • RNA-seqやプロテオミクスの可視化の考え方を紹介する
  • 前段の手順を示す実験フローチャートと併せて全体像を説明する

ボルケーノプロットの作り方

1

ボルケーノプロットを説明する

何を描いてほしいかを、ふだんの言葉で SciFig に伝えるだけ。デザインツールは要りません。

2

SciFig で生成する

説明したとおりの、そのまま論文に載せられる図が数秒で手に入ります。

3

編集して書き出す

編集できる SVG にベクター化し、ラベルを付け直して、論文・ポスター・スライド用に書き出せます。

ボルケーノプロット作成を無料で試す — よくある質問

ボルケーノプロット作成を無料で試すについてよく寄せられる質問。

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コールトゥアクションの背景

出版の準備はできましたか?

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