ボルケーノプロット作成を無料で試す

ボルケーノプロットは、多数の解析対象について効果量と統計的有意性の関係を示します。発現変動解析では、各点が遺伝子やタンパク質を表すことが一般的です。横方向の位置には通常log2変動比を、縦方向には選択したp値の常用対数に負号を付けた−log10（p値）を用います。p値が補正済みか未補正かを明記し、比較の方向も示してください。

はい。無料で始められ、カード登録は不要です。SciFig グラフ（DataChart）が表の効果量と p 値から直接ボルケーノプロットを描画します。列を対応付け、しきい値とラベルを設定し、結果を SVG に変換すればベクターとして自由に編集できます。

CSV を読み込んでそのまま描画します。発現変動解析で得られた効果量と p 値を含む CSV、TSV、TXT、Excel 表を SciFig DataChart に読み込み、効果量と p 値の列、補正の有無、比較の方向、しきい値を指定してください。

変換方法と比較対象の両方を明記します。たとえばlog2変動比では分子となる群と基準群を示し、縦軸には補正済みまたは未補正のp値に対する−log10であることを記載します。log2変動比が正なら、分子の群の値が基準群より高いことを意味します。オンラインの作成ツールは、点群の形だけからこれらの設定を判断できません。

解析計画と統計手法に基づいて、根拠のあるしきい値を使用してください。すべての研究に適した共通の組み合わせはありません。教材にしきい値の線を示す場合は、説明用の例であると明記し、点の色がその線と整合していることを確認します。研究で使うしきい値を作成ツールに選ばせたり、作らせたりしないでください。

はい。SciFig DataChart で列の対応付け、しきい値、ラベル、スタイルを調整し、表から再生成できます。PNG、PDF、TIFF、EPS と Python コードをダウンロードするか、結果を SVG に変換して SciFig Vector Canvas で編集できます。