無料遺伝子発現制御図作成ツール

遺伝子発現制御図は、制御因子を標的遺伝子につなぎ、活性化または抑制を示します。SciFig では、活性化因子、抑制因子、標的、遺伝子産物を編集し、異なる端点と任意のフィードバックで関係を表せます。

遺伝子発現とは遺伝情報から機能を持つ RNA やタンパク質が作られることです。発現制御は、いつ、どこで、どの程度発現するかに関わります。このツールは制御関係を示し、転写と翻訳の順序は別のタンパク質合成図で説明できます。

制御関係の接続には、活性化の矢印か抑制の端点を選びます。色と端点の形で指定した作用を示します。ラベルを変えずに、プリセットの要素間で接続を追加・削除できます。

SciFig には遺伝子発現制御のフィードバック用プリセットがあります。説明する機構に合わせて構成要素を名付け、上流へ戻る制御関係を示せます。入力した関係を描くもので、図から動態を計算したり安定性を予測したりするものではありません。

このページでは、プリセットとラベルを使い、指定した制御因子と標的の関係を描きます。RNA-seq データから制御ネットワークを推定したり、発現変動を計算したりはしません。測定値は別の発現量グラフにして、機構図と並べて提示できます。

ラベル付きの遺伝子発現制御図を SVG または PNG で出力できます。SVG は拡大・縮小できるベクター図に、PNG はスライドや文書に適しています。選択した因子、標的、接続の端点とラベルがまとめて出力されます。