Generatore gratuito di volcano plot
Prova gratis il generatore di volcano plot con dimensioni dell’effetto e valori p. SciFig DataChart (grafici dai tuoi dati) traccia la tua tabella; personalizza soglie ed etichette, poi esporta.
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Aggiornato
Generatore gratuito di volcano plot— modelli ed esempi
Volcano plot per spiegazioni scientifiche chiare
Spiegare gli assi e la direzione del confronto
Prova gratis il generatore di volcano plot con le dimensioni dell’effetto e i valori p della tua analisi statistica. Apri SciFig DataChart (grafici dai tuoi dati) su SciFig e traccerà il grafico da quella tabella.
Mostrare le regioni di soglia senza inventare risultati
Uno strumento online per volcano plot può illustrare come i criteri di dimensione dell’effetto e significatività dividono il diagramma in regioni. Fornisci a SciFig etichette didattiche esplicite e tieni l’esempio distinto dalle evidenze sperimentali. In un’analisi reale, le soglie devono derivare dal metodo, non dall’immagine generata.
Preparare uno schema per la didattica o una presentazione
Crea una figura esplicativa per una lezione sui metodi, una discussione in laboratorio o una guida alla lettura dei risultati di espressione differenziale. SciFig DataChart traccia ogni punto dall’output del software statistico e puoi modificare le etichette prima di esportare in PNG, PDF, EPS o TIFF.
volcano plot: che cos’è?
Un volcano plot mette in relazione la dimensione dell’effetto e la significatività statistica: in genere riporta il log2 del fold change sull’asse orizzontale e il logaritmo in base 10, con segno negativo, di un p-value dichiarato sull’asse verticale. Carica la tabella delle dimensioni dell’effetto e dei valori p in SciFig DataChart (grafici dai tuoi dati), associa le colonne e scegli soglie ed etichette per creare il grafico. Puoi provare gratuitamente il generatore di volcano plot.
Perché illustrare un volcano plot?
- Collegare dimensione dell’effetto e significatività in un’unica figura esplicativa
- Mostrare perché un p-value basso e un fold change elevato rispondono a domande diverse
- Rendere espliciti il gruppo al numeratore e quello di riferimento
- Spiegare la differenza tra p-value corretti e non corretti
- Introdurre le regioni definite dalle soglie prima di discutere un’analisi reale
- Rappresenta i risultati in DataChart dalla tabella delle dimensioni dell’effetto e dei valori p, scegliendo colonne e soglie.
Gli elementi principali di un volcano plot
- Asse orizzontale: la misura dichiarata della dimensione dell’effetto, in genere il log2 del fold change
- Asse verticale: il logaritmo in base 10, con segno negativo, della misura di p-value esplicitamente indicata
- Punti: geni, proteine o altre caratteristiche sottoposte a test in un grafico derivato dai dati. DataChart calcola le posizioni dalle colonne dell’effetto e del valore p associate nella tabella.
- Linee di soglia: limiti specifici dell’analisi o esempi didattici dichiarati come tali
- Legenda dei colori: i criteri esatti che definiscono ciascuna regione evidenziata
- Annotazioni: nomi di caratteristiche selezionate solo se supportati dai dati sottostanti
Quando sono utili i volcano plot esplicativi
- Insegnare a leggere i risultati dell’espressione differenziale
- Spiegare la direzione del fold change in una riunione di laboratorio
- Confrontare i criteri di dimensione dell’effetto e significatività in una guida ai metodi
- Introdurre i concetti di visualizzazione per RNA-seq o proteomica
- Affiancare una panoramica a un diagramma del flusso sperimentale che spieghi le procedure precedenti
- DataChart offre PNG, PDF, TIFF, EPS e codice Python. Per modificare gli elementi vettoriali, converti il risultato in SVG e prosegui in Canvas.
volcano plot: come fare
Carica la tabella
Carica un file CSV o Excel con le misurazioni e i nomi delle colonne necessari per il grafico.
Imposta il grafico e l’analisi
Scegli un tipo di grafico, poi imposta l’associazione delle colonne, le unità, i filtri e le opzioni statistiche; SciFig DataChart traccia ogni valore dalla tua tabella.
Scarica i risultati
Esporta il grafico e i file di analisi, oppure converti il risultato in SVG per modificarlo in SciFig Vector Canvas.
Generatore gratuito di volcano plot — Domande frequenti
Domande frequenti su Generatore gratuito di volcano plot.
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