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Generatore gratuito di diagrammi di regolazione genica

Collega attivatore, repressore e gene bersaglio con relazioni di attivazione o inibizione, poi confronta gli schemi di retroazione e connessione personalizzata.

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Generatore gratuito di diagrammi di regolazione genica— modelli ed esempi

Aggiornato

Strumenti per diagrammi di regolazione genica

Generatore gratuito di diagrammi di regolazione genica

Collega attivatore, repressore e gene bersaglio con relazioni di attivazione o inibizione, poi confronta gli schemi di retroazione e connessione personalizzata.

Un diagramma di regolazione genica mostra come i fattori attivano o reprimono l’espressione. SciFig offre un modello delimitato con fattore, repressore, gene bersaglio e prodotto: etichette modificabili, frecce di attivazione, estremità di inibizione e retroazione negativa facoltativa.

Modello di regolazione genica con attivatore e repressore collegati a un gene bersaglio e al suo prodotto
  • Assegna un nome al fattore regolatorio
  • Usa frecce di attivazione
  • Mostra una connessione regolatoria di ritorno
  • Modifica relazioni di attivazione e inibizione

Funzioni per la regolazione genica

SciFig riunisce dati inseriti, opzioni del diagramma ed esportazione della regolazione genica in un unico strumento.

Collega un regolatore al suo bersaglio

Disponi un fattore regolatorio e il suo gene bersaglio in un diagramma chiaro. Usa i nomi presenti nel tuo materiale. La figura evidenzia quale fattore agisce su quale bersaglio, prima di passare alla discussione di una rete più ampia.

  • Assegna un nome al fattore regolatorio
  • Etichetta il gene bersaglio
  • Mantieni la direzione della connessione
Collega un regolatore al suo bersaglio

Distingui attivazione e repressione

Scegli una freccia per l’attivazione o un’estremità piatta per la repressione. Cambiare relazione mantiene gli oggetti predefiniti e modifica l’effetto dichiarato. Le estremità distinte rendono la connessione leggibile anche in scala di grigi o accanto a una diversa tavolozza.

  • Usa frecce di attivazione
  • Usa estremità di repressione
  • Distingui gli effetti dalle estremità delle connessioni
Distingui attivazione e repressione

Spiega un circuito di retroazione

Con lo schema di retroazione mostri come un prodotto a valle o un regolatore si ricollega a una fase precedente. La retroazione è una relazione del meccanismo fornito, non una previsione ricavata dai valori di espressione. Un singolo circuito aiuta a spiegare la regolazione oltre una catena unidirezionale.

  • Mostra una connessione regolatoria di ritorno
  • Etichetta i componenti del circuito
  • Distingui la retroazione da una catena lineare
Spiega un circuito di retroazione

Modifica un modello regolatorio compatto

Collega attivatore, repressore, gene bersaglio e prodotto predefiniti secondo le relazioni da spiegare. Rinomina gli oggetti, scegli l’effetto di ogni connessione ed esporta la figura. Il diagramma registra le relazioni inserite, senza inferire una rete da una tabella RNA-seq.

  • Rinomina gli oggetti regolatori predefiniti
  • Aggiungi o rimuovi connessioni di attivazione e inibizione
  • Esporta il modello inserito in SVG o PNG
Modifica le connessioni regolatorie

Come creare la figura

Usa i controlli della regolazione genica qui sotto per preparare la figura in base al meccanismo e alle etichette scelti.

  1. Scegli un esempio regolatore-bersaglio

    Parti dalla panoramica, da un esempio di attivazione o da uno di repressione. I fattori regolatori e il gene bersaglio mantengono una disposizione stabile. Scegli lo schema che rappresenta la relazione da spiegare prima di modificare i nomi.

  2. Imposta connessioni e retroazione

    Scegli i nodi di origine e destinazione e indica attivazione o inibizione per la relazione fornita. Puoi modificare o rimuovere le connessioni esistenti. Attiva la retroazione del prodotto genico quando vuoi mostrare un collegamento di ritorno anziché una sola sequenza unidirezionale.

  3. Modifica titolo ed etichette

    Inserisci un titolo descrittivo e sostituisci le etichette dei nodi o delle strutture con i termini del tuo documento. Lo schema mantiene la disposizione anche quando cambiano i nomi. Usa abbreviazioni molecolari coerenti con la spiegazione accanto alla figura.

  4. Scarica la figura con le etichette

    Scegli SVG per una figura vettoriale scalabile o PNG per una slide, una dispensa o un documento. Il diagramma esportato conserva vista ed etichette selezionate. Tienilo insieme alla spiegazione, così eventuali modifiche al testo potranno comparire anche in una nuova esportazione.

Usi dei diagrammi di regolazione genica

Collega la spiegazione del tuo materiale a una figura visibile con un diagramma di regolazione genica etichettato.

Modello di regolazione genica con attivatore e repressore collegati a un gene bersaglio e al suo prodotto

Spiega la regolazione trascrizionale

Un pannello didattico può affiancare un attivatore e un repressore a un gene bersaglio. Etichetta gli oggetti regolatori e assegna l’effetto dichiarato a ogni connessione: il lettore vedrà il rapporto con il prodotto genico senza confondere il pannello con le fasi della sintesi proteica.

Esplora questo esempio
Modello di regolazione genica con attivatore e repressore collegati a un gene bersaglio e al suo prodotto

Confronta controllo positivo e negativo

Prepara due diagrammi con gli stessi nomi di regolatore e bersaglio, ma connessioni diverse. Gli studenti confrontano frecce di attivazione ed estremità di repressione su oggetti familiari. Le forme restano nell’esportazione, rendendo leggibile ogni relazione anche fuori dalla slide della lezione.

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Modello di regolazione genica con retroazione negativa dal prodotto genico al fattore di trascrizione

Introduci la retroazione in un seminario

Attiva la retroazione per mostrare il prodotto genico che torna al proprio regolatore. Confronta questa vista con un diagramma dalle stesse etichette ma senza retroazione. I due pannelli rendono visibile il cambiamento della relazione durante un seminario o una discussione in laboratorio.

Esplora questo esempio
Modello regolatorio personalizzato con un’ulteriore connessione di attivazione dal prodotto genico al repressore

Riassumi un piccolo modello regolatorio

Una panoramica del progetto può mostrare attivatore e repressore che agiscono su un gene bersaglio, insieme al suo prodotto. Etichetta gli oggetti predefiniti e scegli ogni relazione. Ottieni un pannello compatto del meccanismo, distinto da una rete di espressione inferita o da un calcolo di espressione differenziale.

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Modello di regolazione genica con attivatore e repressore collegati a un gene bersaglio e al suo prodotto

Collega regolazione e dati di espressione

Affianca il diagramma regolatorio a un grafico di espressione preparato indipendentemente. Mantieni coerenti i nomi di fattori e bersagli nei pannelli e usa il diagramma per indicare le relazioni discusse. Una mappa di calore può riassumere separatamente le misure; il diagramma non calcola l’espressione differenziale.

Esplora questo esempio
Modello di regolazione genica con attivatore e repressore collegati a un gene bersaglio e al suo prodotto

Prepara un riferimento sul controllo genico

Esporta un SVG etichettato per un pannello del manoscritto o PNG per gli appunti. Mantieni i nomi di regolatori, bersaglio e prodotto e le estremità distinte. Un diagramma della sintesi proteica può spiegare separatamente trascrizione e traduzione quando serve un contesto più ampio.

Esplora questo esempio

Come i ricercatori usano SciFig

Il pannello didattico doveva mostrare un attivatore e un repressore sullo stesso gene, non un’altra sequenza di trascrizione e traduzione. Il diagramma di regolazione genica manteneva insieme fattore, bersaglio e prodotto. Ho scelto i tipi di collegamento ed esportato la figura per confrontare in classe come gli effetti indicati cambiassero la spiegazione del meccanismo.

Mira L.

Docente di genetica molecolare, Università di Helsinki

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configurazione elettronicaDiagramma di configurazione elettronicaFigura di esempio: Generatore di diagrammi della catena di trasporto degli elettroniGeneratore di diagrammi della catena di trasporto degli elettroniFigura di esempio: Schema della regolazione genicaSchema della regolazione genicaFigura di esempio: Generatore di diagrammi della glicolisiGeneratore di diagrammi della glicolisiFigura di esempio: Convertitore da immagine a SVG modificabileConvertitore da immagine a SVG modificabileFigura di esempio: Schema della risposta immunitariaSchema della risposta immunitariaFigura di esempio: Generatore di diagrammi del ciclo di KrebsGeneratore di diagrammi del ciclo di KrebsFigura di esempio: Creatore di schemi di apparati sperimentaliCreatore di schemi di apparati sperimentaliFigura di esempio: Generatore di diagrammi della meiosiGeneratore di diagrammi della meiosiFigura di esempio: Generatore di diagrammi degli orbitali molecolariGeneratore di diagrammi degli orbitali 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Domande sui diagrammi di regolazione genica

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Sfondo della call to action

Diagramma di regolazione genica

Crea un diagramma di regolazione genica

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