Generador de volcano plot gratis

Un volcano plot relaciona el tamaño del efecto con la significación estadística de múltiples variables analizadas. En expresión diferencial, cada punto suele representar un gen o una proteína. La posición horizontal suele indicar el log2 del fold change y la vertical, el logaritmo negativo en base 10 del valor p elegido. Especifica si ese valor está ajustado o sin ajustar e indica el sentido de la comparación.

Sí. Empieza gratis, sin tarjeta: 150 créditos el primer día (3 figuras), créditos de check-in diario que crecen con tu racha (hasta 150 al día): hasta unas 44 figuras en tu primer mes. Invita a un amigo y cada uno recibe 200 créditos más. Los gráficos de SciFig (DataChart) trazan tu volcano plot directamente a partir de los tamaños del efecto y los valores p de tu tabla. Asigna las columnas, define umbrales y etiquetas y convierte el resultado a SVG para una edición vectorial completa.

Representa tu CSV. Da a los gráficos de SciFig los tamaños del efecto y los valores p de tu análisis de expresión diferencial en una tabla CSV, TSV, TXT o Excel, asigna las columnas de efecto y valor p, indica si los valores están ajustados o no y elige la dirección de la comparación y los umbrales.

Indica tanto la transformación como la comparación. Por ejemplo, el log2 del fold change necesita un grupo en el numerador y un grupo de referencia explícitos, mientras que el eje vertical debe especificar que muestra el logaritmo negativo en base 10 de valores p ajustados o sin ajustar. Un log2 del fold change positivo indica valores más altos en el grupo del numerador. Una herramienta de volcano plot en línea no puede deducir estas decisiones de la forma de la nube de puntos.

Usa umbrales justificados por tu plan de análisis y tu método estadístico. No existe una pareja universal válida para todos los estudios. Si una figura didáctica incluye líneas de umbral, identifícalas como ilustrativas y comprueba que los colores de los puntos concuerden con ellas. No permitas que un generador de volcano plot elija o invente los umbrales de tu investigación.

Sí. Ajusta la asignación de columnas, los umbrales, las etiquetas y el estilo en los gráficos de SciFig y vuelve a generar a partir de tu tabla. Descarga PNG, PDF, TIFF o EPS y el código Python, o convierte el resultado a SVG para editarlo en el Lienzo Vectorial de SciFig.