無料の UpSet プロット作成ツール：集合の共通要素を可視化

5 つの調査チームから届いた種の識別子には、リスト内の重複がありました。UpSet ツールは各集合内で 1 件として数えます。調査名を整えて共通部分の大きさで並べ、PNG を保存しました。現地の共同研究者が元の表を開かずに重複を議論できました。

小さな共通部分を非表示にしても和集合の総数が変わらない授業例が必要でした。UpSet ツールに自分で要素を入力し、表示列を絞りました。SVG に集合の総数が残るので、学生は簡略表示を配布資料の完全な例と比較できました。

タンパク質スクリーニングの発表で、行列の横に各測定の名前を読みやすく残したいと思いました。UpSet ツールでラベルと棒の色を調整し、SVG を出力しました。JSON も残したため、共同研究者から別の順序を求められたときに同じリストを開き直せました。

2 集合ごとの重なりをすべて別の発見と扱わず、正確な組み合わせを確認できる点が役立ちました。生息地リストを UpSet ツールに入力し、セミナーに必要な組み合わせを選び、PNG を保存しました。表示を変えても元の集合サイズは確認できました。

方法の実演用に、同僚から短い識別子リストが 8 つ届きました。名前を確認して要素を入力し、UpSet ツールで組み合わせ順と要素数順を比較しました。保存した設定に入力が残り、ワークショップの課題と一緒に再現可能な図を渡せました。